此外，国民党重新执政一年来，党务系统、行政部门和“立法院”之间协调状况不佳的现状，也是马英九决定亲自兼任党主席的重要考虑。去年7月，马英九所提名的“考试院长”张俊彦、“监察院副院长”沈富雄等重要人事案，在国民党占绝对优势的“立法院”都遭遇国民党籍“立委”的极大反弹，最终造成张俊彦自动婉拒提名、沈富雄则未获“立法院”足额同意票而无法出任。在“立法院”法案提案与审议过程中，由于行政部门和党籍“立委”间沟通不畅，致使法案拖宕或与整体施政方针相悖的状况亦层出不穷，曾被媒体形容是“整个立法院，尽是在野党”。

　　据当地媒体分析，马英九接任党主席后，出于党政协调的考虑，可能会安排台湾“行政院长”“立法院长”等出任副主席职务，并对一向没有太多实权的副主席职务重新分工，赋予实际权责；且将施政意志通过党务系统直接注入“立法院”，并加强“中央”与党籍各地方首长的沟通协调。在党的重要人事安排上，也会体现出向青壮世代交棒的色彩。

　　在6月10日的记者会上，马英九对吴伯雄过往“一路走来始终相挺”，表达了感恩和敬意，两人并相拥致意。马英九还称许吴伯雄，在“特别费案”后使党化险为夷，除了拿回失去八年的执政权，还配合政府使两岸融冰、对党与人民都做出了历史性的重大贡献。

　　吴伯雄则对马英九表示，“你的成功就是我这辈子最大的期待”，惟一遗憾的，只有在前段期间内，自己与马英九两人对参选下届党主席与否“都很客气”“都一直说不急不急”，方使“有心人”有机会“放话”，使自己感到“很大的人格伤害”。

　　今年5月初，甫完成第三次“陈江会谈”的江丙坤突然宣布请辞海基会董事长，引发岛内政坛震动。彼时即曾有政坛耳语称，这是为吴伯雄欲在卸任党主席后争取出任海基会董事长一职所做的安排。当时，吴伯雄驳斥传言，痛斥散播耳语者“混蛋至极”“不要把我们（指自己和江丙坤）逼到墙角”。

　　日前，吴伯雄也曾称，自己不可能和马英九同台竞选党主席，虽有部分党内人士批评马英九对吴伯雄等党内大佬“用完就丢”，但吴仍呼吁支持者“不要为我感到委屈、难过”。

　　对于在马英九未来兼任党主席后，国共两党之间两岸互动平台是否仍将持续，两党领导人会面的可能性，马英九表示，党主席职务9月才会交接，如果自己能够胜选，届时才会说明。国民党文传会主委李建荣则告诉《财经》记者，预定在今年7月于湖南举行的第五次“国共论坛”，届时吴伯雄仍将以党主席身份，同荣誉党主席连战一同出席。■